Murray, Mina e o jovem capitão Connor embarcam para a terceira viagem através dos Mares Imaginários.
Desta vez encontram-se à espera deles em Kilmore Cove os piores piratas dos sete mares, e um Long John Silver cada vez mais decidido a combater a Companhia dos Mares Imaginários e o seu louco superintendente Larry Huxley.
Antes, porém, é necessário descobrir onde se esconde Ulysses Moore e libertar os outros rebeldes, e a única maneira de o fazerem é amarrarem-se com cordas e mosquetões e começarem a descer até ao centro da Terra...
Os Piratas dos Mares Imaginários é o seguimento de O Barco do Tempo e Viagem aos Portos Escuros.